VMD
VMD(英语：Visual molecular dynamics, 可视化分子动力学)是一套分子建模与可视化软件[2]，主要用来分析分子动力学模拟的实验数据。同时，软件也包含处理长度与提及相关数据的模块，能可视化与分析轨迹，添加任意图形，并能导出成其他软件能利用的格式例如POV-Ray，PRMan，VRML等。用户能运行Tcl和Python脚本进行批量操作，也可通过Tcl/Tk与其他程序进行交互。VMD能在Unix，MacOS，Microsoft Windows等操作系统下运行[3]。对于非商业用途，VMD通过特定分发协议发布，用户注册后可免费使用和修改源码[4]。
 VMD 1.8.3 软件截图. | |
| 原作者 | 威廉·汉弗莱，安德鲁·达尔克，克劳斯·舒尔顿，约翰·斯通 |
|---|---|
| 开发者 | UIUC |
| 首次发布 | 1995年7月4日 |
| 操作系统 | OS X, Unix, Windows |
| 语言 | English |
| 类型 | 分子建模 |
| 许可协议 | 需注册(Distribution-specific)[1] |
| 网站 | www |
外部链接
- 官方网站
- VMD on GPUs （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- Protein workbench STRAP（页面存档备份，存于互联网档案馆）
参考资料
- ^ VMD license. [2017-01-03]. （原始内容存档于2022-01-21）.
- ^ Humphrey, William; Dalke, Andrew; Schulten, Klaus. VMD: Visual molecular dynamics. Journal of Molecular Graphics. February 1996, 14 (1): 33–38. PMID 8744570. doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5.
- ^ VMD User's Guide Version 1.9.1 (PDF). Massachusetts Institute of Technology. NIH Resource for Macromolecular Modeling and Bioinformatics. [January 29, 2012]. （原始内容 (PDF)存档于2016-06-09）.
- ^ VMD License. Theoretical and Computational Biophysics Group. NIH Center for Macromolecular Modeling & Bioinformatics, University of Illinois at Urbana–Champaign. [4 January 2016]. （原始内容存档于2022-01-21）.